南京南站

南京南站與南京地鐵1號線、南京地鐵3號線、南京地鐵S3號線換乘，總面積為52996平方米，設5個出入口：8號口通向高鐵南京南站、長途客運南站;9號口通向南京南站北廣場西側;10號口通向高鐵南站北廣場東側;11號口通向12號口;12號口通向六朝路。

翠屏山站

翠屏山站位于勝太西路和將軍大道交界處東南側，呈南北走向，緊鄰勝太西路。車站為地下二層島式站臺，負一層為站廳，負二層為站臺層。整個車站留有4個出入口。1號和2號口位于車站東北方位，通向勝太西路、華潤蘇果超市;3號口位于車站東南方位，通向將軍大道;4號口位于車站西北方位，通向將軍大道。

河海大學·佛城西路站

河海大學·佛城西路站位于將軍大道和佛城西路的交界處，呈南北走向，站廳和站臺同層，地下側式站臺。共設3個出入口：1號口位于西南方，通向將軍大道;2號口位于西南方，通向佛城西路;3號口位于東南方，通向佛城東路。

吉印大道站

吉印大道站位于將軍大道和吉印大道的交界處，地下2層島式站臺，呈南北走向，共設3個出入口：1號口位于車站西南方位，通向吉印大道;2號口位于車站東南方位，通向將軍大道和吉印大道;3號口位于車站東北方位，通向將軍大道和吉印大道。

正方中路站

正方中路站位于將軍大道和正方中路、洋珠巷的交界處，是S1號線三座高架站之一，呈南北走向。車站共設2個出入口，均通向將軍大道和正方中路。

翔宇路北站

翔宇路北站位于江寧區翔宇路最北端，是S1號線三座高架站之一，高架島式站臺，呈南北走向。車站共設2個出入口，位于新生路東西兩側。

翔宇路南站

翔宇路南站位于翔宇路以南，是S1號線三座高架站之一，呈南北走向。車站共設4個出入口：1號口位于車站西側，通向小圩王村;2號口位于車站西南側，通向S1號線基地;3號口位于車站東南側，通向周家村;4號口位于車站的神州路東側。

祿口機場站

祿口機場站位于南京祿口國際機場T1航站樓與T2航站樓之間的地下兩層，呈東西走向，2個出入口均通向祿口機場航站樓。